約翰福音共記載了七個在耶穌公開傳道生涯中所行的神蹟，循序漸進地揭示了耶穌作爲神子的身份和使命。這七個神蹟包括：
變水為酒（二 1-11）
醫治大臣的兒子（四 43-54）
醫治畢大池邊的癱子（五 1-15）
餵飽五千人（六 1-14）
在水面上行走（六 16-21）
醫治生來瞎眼的（九 1-12）
叫拉撒路復活 （十一 1－45）
但係…… 我無見過d咁神奇嘅事喎……
我嘅生活普普通通，邊度有神蹟呀？
如果真係有就好啦，可以幫我滿足我嘅願望……
相比起另外三卷福音書，約翰福音所記載的神蹟數目明顯少很多。可見，約翰福音的作者精挑細選這七個神蹟，並透過它們的鋪排帶出信息。
第一個神蹟是將水變為酒。耶穌首次彰顯祂超自然的能力，象徵著新的時代展開，而門徒亦因此相信祂。耶穌之後醫治了大臣的兒子，也强調了祂行神蹟的目的是叫人相信祂。
然而，不是每個人都會因爲看見神蹟而願意相信耶穌。雖然同樣是醫治的神蹟，但猶太人對於耶穌在安息日醫治了在畢大池邊一個生病了三十八年的癱子，並稱神為祂的父，感到相當不滿。他們認爲耶穌在干犯安息日的律法之餘，還犯了僭越神的大罪。此外，在耶穌行了五餅二魚的神蹟後，一些群衆只是想利用耶穌的能力，來達到自己想要推翻羅馬政權的目的。這些猶太人都錯過了耶穌行神蹟的重點。
在之後的神蹟中，耶穌進一步讓人認識祂的身份和與父神的關係。祂在水面上行走，並向門徒說「是我」，呼應了舊約耶和華神的名字，表明自己的神性。在祂醫治了一個生來瞎眼的人後，更宣認自己是神的兒子。耶穌行神蹟的高峰點在於祂使拉撒路從死裏復活，預示祂的受死與復活之餘，更顯出祂勝過死亡的權柄。
隨著耶穌不斷揭示祂的身份，有不少猶太人願意相信耶穌，但也有猶太人商議要殺耶穌。這呼應著耶穌到世上來的使命，就是拯救凡願意相信祂的，審判那些不信的。
親愛的主，感謝祢在我們的生命中彰顯出祢的大能與作爲。祢是掌管我們生命的主，我們願意相信祢。祈求祢教導我們在生活中定睛於祢，做每件事情都不是單靠自己的能力和為自己而做，而是倚靠祢的大能並為祢而做。我們的祈禱，是奉靠主耶穌基督的名字，阿們。